生态河道治理是城市河道污染治理必不可少的，但传统的工程修复往往带有许多认为干涉影响。在进行河道治理过程中又影响了河道的其他功能，所以总体效益很小。通过符合生态学方面的治理措施，减少认为干涉，建立河流的生态系统，完善其生态功能，使其具有自我修复自我净化的功能，最终成为亲水宜人的环境生态景观，满足城市社会经济生活发展需要，建设和谐的生态家园。
生态河道治理主要分为以下三步：
一、 修复河岸植被。在干支流各明渠段，恢复河岸带植被，充分发挥河岸带植被的缓冲带功能和护坡效应，尽可能恢复和重建退化的河岸带生态系统，保护和提高生物多样性。
二、 修复河道形态。重新营造出接近自然的流路和有着不同流速带的水流，即修复河流浅滩和深塘，有利于形成水的紊流，造就水体流动多样性，以有利于生物的多样性。
三、 修复河床断面。主要是改造水泥和混凝土硬化河床，修复河床的多孔质化，同时改造护岸，建设生态河堤，为水生生物重建生息地环境。改变现有僵硬、沉闷、单调的灰色混凝土护岸为草皮或地衣植被覆盖的柔性护坡。部分河段可拆除以前在河床上铺设的硬质材料，修复河床自然泥沙状态；部分河段釆用复式断面，可以种草、爬藤类植物或栽植低矮乔木，平时作为河道立体绿化的一部分；慎重考虑河道覆盖与侵占河道；改造原有河道护坡和护岸结构，修建生态型护岸。
