一、城市生态河道治理的综合性原则
这里的综合性原则不仅仅是指满足人们对于城市生态河道的用水需求。而且还包括城市生态河道的生态功能发挥。因此，在实际的城市生态河道治理过程中有关部门需要严格遵守河道治理的综合性原则。选择最优质的城市生态河道治理方案，实现城市生态河道治理综合效益最大化。
为了不断实现河道的生态治理，恢复河道生态系统功能，要遵循几个方面的原则。
第一，综合性原则，即在进行生态河道治理工程时，要首先保证河道的基本功能，例如，防洪、引水等，在此基础上再考虑其他生态功能的完善。
第二，保证协调性。在进行生态修复时，要注意河道与周边环境发展的特点，注重整体风貌的协调发展。
第三，要以自然修复为主。
第四，要保证河道的修复与经济、社会的发展同步进行，尽可能地对河道的生态治理工程进行统一的统筹安排，以实现经济化治理目标，实现可持续发展。
二、城市生态河道治理的协调性原则
城市生态河道治理的需要做到与当地的风俗以及周围的环境相协调，按照城市发展特点以及河道的延曲状况进行治理，将河道沿线的周围风光以及整体风貌相结和。
三、城市生态河道治理的自然性原则
城市生态河道治理，不仅仅要因地制宜，还要做到人工修复与自然修复相结合，尤其是对于地形、水文、水下生物等多种因素进行考虑，提高城市生态河道的自然化，保障好城市生态河道水系统的自我能力。
四、城市生态河道治理的经济成本原则
最大限度的降低城市生态河道治理成本，获得最大的经济效益，这是城市生态河道治理的关键性问题。在进行城市生态河道治理的过程中，有关部门治理中需要对于河道治理目标有着清晰的认识。无论是前期的城市生态河道建设期，还是后期的城市生态河道维护期，有关部门都需要做好规划与设计。将城市生态河道治理成本控制在最低限度，提高城市生态河道治理综合效益，促进城市生态河道治理可持续发展。
生态河道治理概念的提出已有很长时间，起初，一些发达国家结合当地的地理和气候条件，提出建设生态河道的理念，经过一系列的修复和整改，水环境有很大的改观，河道治理取得很大进步。因此，我国进行生态河道治理十分必要，也要结合不同地区的不同地理环境和气候特点进行。进行生态河道治理，常用的方法有以下几个。
1、恢复河道的生态功能
生态河道治理的目的就是为了在保证河道基本功能的基础之上，恢复河道的生态系统，为各种生态活动提供适宜的环境。因此，在进行河道治理时，应该本着为人们的居住以及各种生物的活动提供良好的环境为目标，对传统的河道治理过程中所采用的混凝土河床、护岸等进行改造，已恢复河道的生态功能。恢复河道本来面目，一般是对河道中的浆砌石护岸的上半部分进行拆除，换做土料筑堤，自然草皮护坡，还可以采用生态混凝土草坪护坡。对河道中的混凝土护岸进行部分拆除，有利于河道在自然力的作用下，形成形形色色的水路，构造出多种形态的适宜生物生存的水环境。同时，河道断面宽窄不一，深浅不一的变化往往能增加河道的蓄水能力，发挥调节功能，有利于防汛等。同时也有利于增强河道的自我净化能力，改善河水的质量。
2、河道设计要多样化
在进行河道规划时，要采用多种设计方式相结合，比如适合鱼类生存的鱼巢块体护岸，适合蛙类生存的两栖块体护岸等。护岸的设计要考虑到河流的特点以及生态情况，尤其是为了保护河流生物的生存和繁殖环境，在进行河道治理时要选取合适的材料，并且根据河道内生物的情况进行设计，以保证满足人类以及各种水生物对水环境的需求。
3、加强岸坡的防护
在进行河道治理过程中，岸坡的防护也是一个不可忽视的方面。要尽可能地保持岸坡原来的形态，尽量保存岸坡原生的植被。自然植被对岸坡的保护能力往往大于人为方式，尤其要尽量少用人为的干砌石、浆砌石或混凝土护坡等形式，对于已经出现问题的岸坡，可以多种栽植物进行保护，达到防冲固坡的目的。
4、绿化河道，还原河面环境
以前的河道治理大多采用在小河沟上盖水泥板，填平各种池塘、洼地等。这样可以扩大对空间的利用程度，但同时也对生态环境造成了危害，减少了水面面积。如今的河道治理，结合了生态特征，主要采用开敞河道的做法来进行河道治理，以便为人们的生存以及各种水生物的生存提供良好的环境。例如在非汛期，河道要提供休闲娱乐的功能，在汛期，要产生防汛功能等。因此，为了使河道的发展适应人们的生活，要不断对河岸的环境进行美化、使得河流能与周围环境相映衬，形成数量多、空间广、连续性强、物种丰富的生态环境。另外，还原河面环境是河道治理的重要方面，河流是城市不可或缺的部分，河流水源是一个关键因素，然而当前的自然水循环情况并不良好，对河道治理也有一定影响。因此，可以把花坛、路面、雨水管道等基础设施设计成为透水性的构造，以促进雨水渗透的畅通，也有助于改善河道的水环境。再如，在大型建筑、学校、公园等建设中，也可以不断推广雨水渗透技术，这样可以不断促进自然水循环系统的畅通，有助于改善生态环境。
