治理的难度除了解决河道内原有污染外，关键是硝化、吸收、降解外来污染源的侵入。根据生态学原理，利用水生生态动植物及微生物的自净能力吸收水体中的有机污染物，以达到水质净化的目的。综合国内外当前整治河道污染水体的技术，结合投资和价格比较的原则，认为采用微生物和水生植物培育相结合的技术是治理，建立一个具有自净能力生态系统，是较为科学合理的途径，而且适应低成本长效管理。

选用的微生物（Bacta-Pur XLG系列）其主要成份是生物活性酶和发酵过程中特选微生物组成。尤其是对激活和优化生物过滤系统的处理有特别的功效，是运用于水中的富营养化、有机物污染，同时能降解底泥，净化水质。这种微生物是从自然界筛选的优势菌种经过分离、驯化、适应性培养，在活体状态下浓缩、固化而成的一种生物产品，它对环境具有很强的适应性，分解污染物能力更强。属于环境友好产品，不会产生二次污染，对人和动物无危害，已通过国家毒性检验。该产品已被例入美国、欧洲等国家应急计划产品目录（NCP）。该产品在美国、英国、意大利、德国、中国和法国等许多国家具有专利，是美国、加拿大、台湾等许多国家和地区环保部门推荐使用产品。该产品优点是适用环境的能力较强，分解硝化有机物能力强。如果PH=6.5～7.2，水温≥150C时效果更加明显。

向水体中投放微生物是分解、矿化水体中有机物，调节水质、提高透明度，有效促进并完善水中有机质和营养盐的迁移、转化、输出的过程。通过微生物的繁衍恢复河道的水体自净能力。